Según la secuencia final de las Tortugas Ninja, Krang intentó enviarlos a la Dimensión X para evitar que interfirieran en su invasión de la Tierra. Sin embargo, las Tortugas terminaron en una Tierra paralela amenazada por Brainiac. Junto con sus hermanos, Leonardo luchó contra una variedad de héroes y villanos.
Después de que Brainiac fue derrotado, las Tortugas recibieron una "pizza super salada" de parte de Harley Quinn; esta pizza había sido tratada con la nanotecnología 5-U-93-R, convirtiéndolos temporalmente en "ultra-tortugas". Volviendo a su propia dimensión, las Tortugas fueron así potenciadas lo suficiente como para que Leonardo pudiera levantar un taxi sobre su cabeza y usarlo como arma contundente contra Krang.
